Mağusa Spor Akademisi (MSA) gibi futbol akademileri, gerekli hukuki gereksinimleri tamamlayıp, Kıbrıs Türk Futbol Federasyonu'na kayıtlı kulüp oldukları durumunda, alt yapı liglerine katılabilecek. Mağusa Spor Akademisi, Kıbrıs Türk Futbol Federasyonu'nun organize ettiği gerek Kadınlar Lig'inde gerekse alt yapı liglerinde mücadele ediyor. Ancak ülkemizde faaliyet gösteren Türkiye kulüplerinin alt yapıları, Kıbrıs Türk Futbol Federasyonu'nun organize ettiği liglerde mücadele edemeyecekler.
