Seribaşı olarak katılacak 8 takım birbiriyle eşleşmeyecek, gruplarda 2.inci sırayı alan diğer 8 takım ise seri başı takımlarla eşleşecek. Son 16 takımın eşleşmesiyle oynanacak olan karşılaşmalar deplasmanlı çift maç eleme sistemine göre oynacak. Karşılaşmalar sonrası galip gelecek olan takımlar statüde belirtilen şablona göre çeyrek final eşleşmelerini yapacak.
U15 Ligi Son 16 1.Maçları 15-16 Nisan 2017 tarihlerinde ve 2.Maçlar ise 22-23 Nisan 2017 tarihlerinde oynanacak.
Son 16 takım arasına giren takımlar şöyle:
Seribaşı Takımlar: Binatlı Yılmaz Spor Kulübü, Dumlupınar Türk Spor Kulübü, Esentepe Kurtuluş-Kültür Spor Kulübü, Karadeniz 61 Spor Kulübü, Küçük Kaymaklı Türk Spor Kulübü, Mesarya Spor Kulübü, Türk Ocağı Limasol, Yenicami Ağdelen Kulübü
Diğer 8 takım: Baf Ülkü Yurdu, Cihangir Gençlik Spor Kulübü, Çetinkaya Türk Spor Kulübü, Dipkarpaz Spor Kulübü, Doğan Türk Birliği, Lapta Türk Birliği, Mağusa Spor Akademisi, Yeni Boğaziçi Doğan Türk Spor Kulübü